Dina Research School

Workshop: Biosekvensanalyse

Koldkærgård Landboskole, Skejby, 6-7 april 2000

Indbydelse

Biosekvensanalyse er datamatisk og statistisk behandling af biologiske sekvensdata, dvs. DNA og RNA-sekvenser samt proteinsekvenser. Kortlægningen af utallige organismers arvemateriale er gået meget stærkt i de seneste år, men hvad kan man bruge de indsamlede data til, hvordan går man rent praktisk til værks, og hvordan virker de computerprogrammer der ligger bag?

Workshoppen vil søge at besvare disse spørgsmål gennem sessioner om følgende emner:

• hvordan man søger i de eksisterende sekvensdatabaser
• hvordan de fundne data kan bruges til at opbygge fylogenetiske træer (slægtstræer) for organismer man ellers ikke ved noget om
• hvordan alignment algoritmer for DNA/RNA og proteinsekvenser faktisk er organiseret i computeren
• hvordan man finder ud af hvilke dele af genomet der bestemmer hvilke fænotypiske træk (genkort, koblingsanalyse, quantitative trait loci)
• hvilke fremtidsperspektiver for biologisk forskning ligger der i de stadig større datamængder, og i udviklingen af nye datamatiske og statistiske metoder

Der er knyttet praktiske computer-øvelser til de fleste af emnerne.

Workshoppens målgruppe er

• dels ph.d.-studerende der forstår genetikken og eventuelt faktisk anvender biosekvensdatabaser osv, men gerne vil have bedre indblik i datalogien og statistikken bag
• dels ph.d.-studerende der har en datalogisk eller statistisk baggrund, og gerne vil have en bedre forståelse af de biologiske anvendelser

Du er særdeles velkommen til at bidrage med en poster om dit eget arbejde hvis det involverer biosekvenser under en eller anden form.

Vel mødt på Koldkærgård Landboskole!

Author: phd@dina.kvl.dk. Updated: 1 March 2000